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Hybridization-based detection of Helicobacter pylori at human body temperature using advanced Locked Nucleic Acid (LNA) probes

Título
Hybridization-based detection of Helicobacter pylori at human body temperature using advanced Locked Nucleic Acid (LNA) probes
Tipo
Artigo em Revista Científica Internacional
Ano
2013
Autores
Sílvia Fontenete
(Autor)
FEUP
Nuno Guimarães
(Autor)
FEUP
Marina Leite
(Autor)
Outra
Céu Figueiredo
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Jesper Wengel
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Nuno Filipe Azevedo
(Autor)
FEUP
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Revista
Título: PLoS ONEImportada do Authenticus Pesquisar Publicações da Revista
Vol. 8 11
Páginas: 1-11
ISSN: 1932-6203
Outras Informações
ID Authenticus: P-006-JHZ
Abstract (EN): The understanding of the human microbiome and its influence upon human life has long been a subject of study. Hence, methods that allow the direct detection and visualization of microorganisms and microbial consortia (e. g. biofilms) within the human body would be invaluable. In here, we assessed the possibility of developing a variant of fluorescence in situ hybridization (FISH), named fluorescence in vivo hybridization (FIVH), for the detection of Helicobacter pylori. Using oligonucleotide variations comprising locked nucleic acids (LNA) and 2'-O-methyl RNAs (2'OMe) with two types of backbone linkages (phosphate or phosphorothioate), we were able to successfully identify two probes that hybridize at 37 degrees C with high specificity and sensitivity for H. pylori, both in pure cultures and in gastric biopsies. Furthermore, the use of this type of probes implied that toxic compounds typically used in FISH were either found to be unnecessary or could be replaced by a non-toxic substitute. We show here for the first time that the use of advanced LNA probes in FIVH conditions provides an accurate, simple and fast method for H. pylori detection and location, which could be used in the future for potential in vivo applications either for this microorganism or for others.
Idioma: Inglês
Tipo (Avaliação Docente): Científica
Nº de páginas: 11
Documentos
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