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Prediction of melting temperatures in fluorescencein situhybridization (FISH) procedures using thermodynamic models

Título
Prediction of melting temperatures in fluorescencein situhybridization (FISH) procedures using thermodynamic models
Tipo
Artigo em Revista Científica Internacional
Ano
2016
Autores
Sílvia Fontenete
(Autor)
FEUP
Nuno Guimarães
(Autor)
FEUP
Jesper Wengel
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Nuno Filipe azevedo
(Autor)
FEUP
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Revista
Vol. 36 3
Páginas: 566-577
ISSN: 0738-8551
Editora: Taylor & Francis
Outras Informações
ID Authenticus: P-00M-GGD
Resumo (PT):
Abstract (EN): The thermodynamics and kinetics of DNA hybridization, i.e. the process of self-assembly of one, two or more complementary nucleic acid strands, has been studied for many years. The appearance of the nearest-neighbor model led to several theoretical and experimental papers on DNA thermodynamics that provide reasonably accurate thermodynamic information on nucleic acid duplexes and allow estimation of the melting temperature. Because there are no thermodynamic models specifically developed to predict the hybridization temperature of a probe used in a fluorescence in situ hybridization (FISH) procedure, the melting temperature is used as a reference, together with corrections for certain compounds that are used during FISH. However, the quantitative relation between melting and experimental FISH temperatures is poorly described. In this review, various models used to predict the melting temperature for rRNA targets, for DNA oligonucleotides and for nucleic acid mimics (chemically modified oligonucleotides), will be addressed in detail, together with a critical assessment of how this information should be used in FISH.
Idioma: Inglês
Tipo (Avaliação Docente): Científica
Nº de páginas: 12
Documentos
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